La maggior parte delle donne lamentano questi disturbi:

- dolore pelvico cronico,

- dolori molto intensi durante le mestruazioni e in fase ovulatoria,

- dolori durante o dopo i rapporti sessuali,

- dolore o senso di peso nel retto,

- dolore quando si urina o defeca,

- dolore nella regione lombare o lungo gli arti inferiori,

- mestruazioni abbondanti e dolorose,

- stanchezza,

- depressione,

- irritabilità,

- gonfiore addominale,

- diarrea e/o stitichezza,

- sangue nelle feci,

- sangue nelle urine,

- cefalea,

- allergie e intolleranze alimentari,

- nausea,

- vomito,

- febbricola,

- infertilità e sterilità,

- aborti spontanei.

Normalmente il sintomo più comune è il dolore, anche se in alcuni casi l'endometriosi può essere asintomatica. Il dolore più o meno intenso non dipende dalla gravità della malattia. Piccoli focolai endometriosici, possono essere causa di forti dolori.