Le donne affette da endometriosi corrono il rischio di ammalarsi anche di altre patologie quali:

la fibromialgia
(un dolore ricorrente nei muscoli, i tendini e i legamenti)

le malattie atopiche (allergie, asma)

le malattie autoimmuni
(date dal malfunzionamento del sistema immunitario che attacca i tessuti sani dell'organismo) quali l'artrite reumatoide, la sclerosi a placche ecc..

le malattie endocrine
(i disturbi dei tessuti ghiandolari) quali la tiroide, il pancreas, l'ipofisi ecc..

la sindrome da stanchezza cronica
(una forte sensazione di spossatezza che dura almeno sei mesi senza interruzione)

alcuni tipi di tumori
i più frequenti sono i tumori dell'ovaio, della mammella, i tumori ematologici quali i linfomi ed il melanoma.